Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nmd3Q99L48 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms