Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms