Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Card11Q8CIS0 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Card11Q8CIS0 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Card11Q8CIS0 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Card11Q8CIS0 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms