Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms