Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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