Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Znf428Q8C1M2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms