Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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