Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ubash3bQ8BGG7 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubash3bQ8BGG7 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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