Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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ChfrQ810L3 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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ChfrQ810L3 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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ChfrQ810L3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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ChfrQ810L3 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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ChfrQ810L3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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ChfrQ810L3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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ChfrQ810L3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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ChfrQ810L3 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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ChfrQ810L3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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ChfrQ810L3 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms