Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms