Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atg9bQ6EBV9 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atg9bQ6EBV9 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atg9bQ6EBV9 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atg9bQ6EBV9 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms