Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

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Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf123Q5XPI3 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf123Q5XPI3 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213 ms