Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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