Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sec31aQ3UPL0 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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