Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Gm24362-201ENSMUST00000183220 416 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 AC164315.1-202ENSMUST00000226723 657 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r-ps113-201ENSMUST00000121318 1106 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Ang-202ENSMUST00000171688 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Olfr770-201ENSMUST00000062314 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm18616-201ENSMUST00000222898 1400 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf166Q3U9F6 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf166Q3U9F6 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf166Q3U9F6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf166Q3U9F6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf166Q3U9F6 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf166Q3U9F6 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms