Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms