Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms