Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ttc21bQ0HA38 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ttc21bQ0HA38 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21bQ0HA38 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ttc21bQ0HA38 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ttc21bQ0HA38 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc21bQ0HA38 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc21bQ0HA38 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc21bQ0HA38 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc21bQ0HA38 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ttc21bQ0HA38 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ttc21bQ0HA38 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ttc21bQ0HA38 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.1 ms