Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms