Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HpcaP84075 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HpcaP84075 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HpcaP84075 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HpcaP84075 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HpcaP84075 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HpcaP84075 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HpcaP84075 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HpcaP84075 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HpcaP84075 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HpcaP84075 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HpcaP84075 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HpcaP84075 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HpcaP84075 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HpcaP84075 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HpcaP84075 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms