Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm30373-202ENSMUST00000217507 2709 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 4933427D06Rik-204ENSMUST00000168837 2467 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Dhx8-201ENSMUST00000039152 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Pcdh1-201ENSMUST00000057185 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Mfsd8-201ENSMUST00000026859 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm37052-201ENSMUST00000194929 1831 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Zmym1-201ENSMUST00000055013 3001 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 A630001O12Rik-201ENSMUST00000212914 2182 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Pvt1-203ENSMUST00000181657 2798 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm43318-201ENSMUST00000199939 1949 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Olfr429-202ENSMUST00000216346 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Scml2-202ENSMUST00000074802 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Ankdd1b-201ENSMUST00000055607 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Zfp54-201ENSMUST00000007884 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm46218-202ENSMUST00000215520 1956 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 C87436-203ENSMUST00000113700 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Adgrl2-203ENSMUST00000168352 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Ctns-202ENSMUST00000108476 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Lyn-202ENSMUST00000103010 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 D030018L15Rik-203ENSMUST00000140253 2902 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Bhlhe40-201ENSMUST00000032194 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Lipe-204ENSMUST00000149349 3713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Hdac7-206ENSMUST00000119670 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 A430046D13Rik-201ENSMUST00000180477 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Phf21a-208ENSMUST00000111294 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Odf2-210ENSMUST00000113765 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms