Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Otx2P80206 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Otx2P80206 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Otx2P80206 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Otx2P80206 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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