Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tra2bP62996 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms