Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Nrep-201ENSMUST00000051087 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Fndc7-202ENSMUST00000102620 3477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Rnft1-201ENSMUST00000020827 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csrnp3P59055 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Gm43135-201ENSMUST00000196442 3462 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Gm30373-201ENSMUST00000215774 3500 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Hapln3-203ENSMUST00000206092 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Ftsj3-201ENSMUST00000021048 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csrnp3P59055 Uhrf1-204ENSMUST00000113039 3391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms