Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp5bP56480 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp5bP56480 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms