Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VdrP48281 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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VdrP48281 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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VdrP48281 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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VdrP48281 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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VdrP48281 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Nifk-201ENSMUST00000027626 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm44951-201ENSMUST00000206449 2024 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VdrP48281 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
VdrP48281 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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