Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Gm45289-201ENSMUST00000211048 2577 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3aP47708 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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