Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cdkn1bP46414 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms