Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Hoxc11P31313 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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