Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Fabp5-201ENSMUST00000029046 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm11800-201ENSMUST00000120050 579 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm22481-201ENSMUST00000122562 192 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm1758-201ENSMUST00000164528 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 1700034B16Rik-201ENSMUST00000180957 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm42067-202ENSMUST00000210917 410 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Ryk-ps1-201ENSMUST00000219713 235 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 AC140426.1-201ENSMUST00000227933 459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm26241-201ENSMUST00000174944 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm23976-201ENSMUST00000175001 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm22463-201ENSMUST00000175274 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm22547-201ENSMUST00000175281 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm22913-201ENSMUST00000175297 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm23282-201ENSMUST00000175306 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm25972-201ENSMUST00000175374 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm22414-201ENSMUST00000175466 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm26235-201ENSMUST00000175533 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm25084-201ENSMUST00000175556 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm24973-201ENSMUST00000175588 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm23292-201ENSMUST00000175618 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm25145-201ENSMUST00000177640 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm23646-201ENSMUST00000178119 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm24643-201ENSMUST00000178305 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
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PtprmP28828 Gm22825-201ENSMUST00000179444 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
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PtprmP28828 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 1700066J03Rik-202ENSMUST00000224280 516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm33180-201ENSMUST00000217109 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprmP28828 4933424L21Rik-201ENSMUST00000142486 1186 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm6463-201ENSMUST00000182090 966 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprmP28828 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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