Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl3P27659 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms