Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm11231-201ENSMUST00000117895 1706 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 1700030N03Rik-206ENSMUST00000191405 651 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Pcbd1-202ENSMUST00000218005 361 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Ccdc65-201ENSMUST00000003444 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tgfb2P27090 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Gm38220-201ENSMUST00000195774 1447 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Gm14108-201ENSMUST00000122234 494 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Gm19668-201ENSMUST00000178581 747 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Acsm5-204ENSMUST00000207387 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb2P27090 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms