Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd12P23812 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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