Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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