Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P10404 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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P10404 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
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P10404 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
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P10404 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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P10404 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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P10404 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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P10404 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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P10404 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P10404 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P10404 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P10404 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P10404 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P10404 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P10404 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P10404 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P10404 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P10404 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P10404 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P10404 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P10404 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P10404 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P10404 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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