Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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H2-Eb1P04230 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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H2-Eb1P04230 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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H2-Eb1P04230 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-Eb1P04230 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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H2-Eb1P04230 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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H2-Eb1P04230 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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H2-Eb1P04230 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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H2-Eb1P04230 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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H2-Eb1P04230 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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