Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ifnb1P01575 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifnb1P01575 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifnb1P01575 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifnb1P01575 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifnb1P01575 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifnb1P01575 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifnb1P01575 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifnb1P01575 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifnb1P01575 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifnb1P01575 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifnb1P01575 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifnb1P01575 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifnb1P01575 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifnb1P01575 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifnb1P01575 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ifnb1P01575 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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