Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3239L7N2D9 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms