Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm2056J3QQ02 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm2056J3QQ02 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm2056J3QQ02 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm2056J3QQ02 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm2056J3QQ02 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm2056J3QQ02 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm2056J3QQ02 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm2056J3QQ02 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm2056J3QQ02 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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