Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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BC024978J3QPC3 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC024978J3QPC3 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC024978J3QPC3 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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