Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms