Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
H2-M1F7CXU4 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms