Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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