Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc8E9PWG2 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms