Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Clrn2B2RVW2 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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