Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Ilf3Q9Z1X4 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms