Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rabgef1Q9JM13 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rabgef1Q9JM13 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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