Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM05

Pias4, E3 SUMO-protein ligase PIAS4, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias4Q9JM05 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pias4Q9JM05 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms