Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Trim2Q9ESN6 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms