Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm29599-201ENSMUST00000185285 422 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm14419-201ENSMUST00000108975 683 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms